Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
OTOP1Q7RTM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP1Q7RTM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms