Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCQ7LC44 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCQ7LC44 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms