Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT2Q7L5N7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms