Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms