Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM47EQ6ZV65 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM47EQ6ZV65 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms