Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX8Q6ZV50 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms