Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00336Q6ZUF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00336Q6ZUF6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms