Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD2Q6Y1H2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD2Q6Y1H2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms