Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALKAL1Q6UXT8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALKAL1Q6UXT8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1Q6UXT8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms