Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC171Q6TFL3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC171Q6TFL3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms