Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q6Q795 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q6Q795 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Q6Q795 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Q6Q795 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q6Q795 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Q6Q795 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q6Q795 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Q6Q795 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Q6Q795 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Q6Q795 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Q6Q795 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms