Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO38Q6PIJ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO38Q6PIJ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms