Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKN3Q6P5Z2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKN3Q6P5Z2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PKN3Q6P5Z2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms