Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASC4Q6P4E1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms