Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HMBOX1Q6NT76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms