Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPN13Q6MZZ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPN13Q6MZZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms