Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A4Q6AI14 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A4Q6AI14 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms