Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TNS3Q68CZ2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TNS3Q68CZ2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TNS3Q68CZ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms