Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGNBP1Q5YKI7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GGNBP1Q5YKI7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms