Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF123Q5XPI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNF123Q5XPI4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNF123Q5XPI4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms