Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM104BQ5XKR9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms