Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATRNL1Q5VV63 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 400.4 ms