Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EFCAB2Q5VUJ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
EFCAB2Q5VUJ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EFCAB2Q5VUJ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms