Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYDE2Q5VT97 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYDE2Q5VT97 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYDE2Q5VT97 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms