Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HDGFL1Q5TGJ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HDGFL1Q5TGJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HDGFL1Q5TGJ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms