Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RSPH4AQ5TD94 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms