Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY2Q5TAB7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY2Q5TAB7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms