Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC122Q5T0U0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC122Q5T0U0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms