Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH2D4BQ5SQS7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D4BQ5SQS7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D4BQ5SQS7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms