Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCTE1Q5JU00 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCTE1Q5JU00 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms