Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A13Q5J8X5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A13Q5J8X5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms