Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RTL5Q5HYW3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RTL5Q5HYW3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RTL5Q5HYW3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms