Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERC4Q5GLZ8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERC4Q5GLZ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HERC4Q5GLZ8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
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