Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK2Q5EBM0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK2Q5EBM0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK2Q5EBM0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms