Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPAT3Q53EU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPAT3Q53EU6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPAT3Q53EU6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPAT3Q53EU6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPAT3Q53EU6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPAT3Q53EU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPAT3Q53EU6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms