Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VWA3BQ502W6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VWA3BQ502W6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA3BQ502W6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms