Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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