Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRK1Q38SD2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRK1Q38SD2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRK1Q38SD2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRK1Q38SD2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRK1Q38SD2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRK1Q38SD2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms