Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P3H1Q32P28 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P3H1Q32P28 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H1Q32P28 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms