Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C18orf21Q32NC0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C18orf21Q32NC0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C18orf21Q32NC0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms