Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DRB5Q30154 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HLA-DRB5Q30154 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms