Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VWC2Q2TAL6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VWC2Q2TAL6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms