Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTC1Q2NKJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms