Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIDA1Q1XH10 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms