Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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