Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNOP1Q1ED39 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNOP1Q1ED39 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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