Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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CRY1Q16526 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
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CRY1Q16526 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRY1Q16526 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRY1Q16526 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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