Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZFHX3Q15911 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZFHX3Q15911 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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