Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS72Q15906 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VPS72Q15906 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
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