Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85BQ15834 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC85BQ15834 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85BQ15834 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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