Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEBPEQ15744 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEBPEQ15744 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms